Il microbioma endometriale è costituito dall’insieme dei microrganismi (microbiota endometriale) che colonizzano il lume dell’endometrio senza danneggiarlo, almeno in condizioni di normale funzionamento del sistema immunitario.

La valutazione del microbioma endometriale è oggetto di studio in relazione all'infertilità femminile.

In condizioni normali, in donne sane in età riproduttiva, la specie colonizzante più presente è il L­actobacillus. I Lactobacilli agiscono come probiotici in grado di inibire la crescita di batteri, virus e funghi patogeni, attraverso un abbassamento del pH mediato dalla produzione di acido lattico. In questi casi l'endometrio si definisce Lactobacillus dominated (LD) e contiene una percentuale di lattobacilli >90% (<altri batteri).

In condizioni patologiche, la percentuale di lattobacilli diminuisce percentuale (<90%) e la percentuale di altri batteri aumenta (>10%).

L'endometrio viene quindi definito non-Lactobacillus-dominated (NLD).

Le donne che non riescono a concepire a causa di un’infertilità di tipo idiopatico sono spesso caratterizzate da un alterato microbiota endometriale, con un aumento di colonizzazione da parte di batteri anaerobi come Atopobium, Prevotella, Veillonella, Ureaplasma ed Escherichia.

Il più importante esempio di patologia causata da un’alterazione del microbiota endometriale è l’endometrite cronica (CE).

La CE è caratterizzata da persistente infiammazione delle mucose ed è spesso asintomatica e non evidenziabile ai controlli ecografici. Si stima che nel 39% degli insuccessi riproduttivi la donna sia affetta da CE, fino a percentuali di 60% in donne con aborti ricorrenti (RPL) e 66% in donne caratterizzate da ripetuti fallimenti ^1-2.